Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hace1Q3U0D9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms