Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms