Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TTL0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TTL0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms