Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem38aQ3TMP8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem38aQ3TMP8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms