Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf3c3Q3TMP1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf3c3Q3TMP1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms