Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca4Q3TKT4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms