Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pde12Q3TIU4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms