Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2f1Q3THK3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2f1Q3THK3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms