Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prr27Q3SYJ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms