Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riiad1Q3KNY5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms