Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3KNL4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms