Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nell1Q2VWQ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nell1Q2VWQ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nell1Q2VWQ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nell1Q2VWQ2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nell1Q2VWQ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nell1Q2VWQ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nell1Q2VWQ2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms