Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ush2AQ2QI47 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms