Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam178bQ24JP3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms