Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd9Q14BI7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd9Q14BI7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms