Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc162pQ0VG85 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms