Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc39dQ0VF76 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc39dQ0VF76 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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