Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms