Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Itgb8Q0VBD0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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