Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms