Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn2bQ0KL01 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn2bQ0KL01 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms