Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms