Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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