Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc4Q08624 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms