Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms