Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms