Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPINDOCQ05AH6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms