Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprgQ05909 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms