Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms