Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox10Q04888 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox10Q04888 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms