Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms