Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top1Q04750 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms