Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms