Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms