Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnd1Q03719 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms