Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms