Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msx2Q03358 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms