Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms