Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col6a2Q02788 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms