Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb4Q02738 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms