Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms