Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms