Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hoxd1Q01822 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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