Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms