Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms