Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms