Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms