Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfaQ00731 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms