Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms