Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms